《永远之久远》的故事是讲述由于某些缘由，有不少正处于青春期的少男少女突然醒觉了某种才干——他们拥有把他们最盼望的想法化成事实的才干。虽然可以把自己的想法化成事实看似很美妙，但当他们滥用新才干时，他们便会给才干腐蚀并失掉自我，最后化成怪物“Besutia”。而本作的男主角三槌久远，同様是才干者的他不但没有舍弃他们，并接受了他们的灵魂。在有数的早晨，久远与这些孤独的少男少女们一同生活著。另一方面，巧妙的组织“Ordo”派出了机器的猎犬“Custodes”狩猎著久远他们。挖苦的是，这些猎犬也是除了大脑及神经以外，其他局部均换成机器的怪物。异端狩猎著异端的挖苦，谁也逃不过这负面的连锁。就这様，久远和少男少女们与这些Custodes继续战役著。流著血的久远，也在寻求著明天。