这是一部经典的美国的动画片。一天，一家工厂走漏的有毒化学物质流到了纽约市的地下水道，这些化学物质令到四只伟大的小海龟发作了基因突变，变成了像人一样能站立行走的人形海龟，他们区分是米开朗基罗、达芬奇、拉斐尔和多纳泰罗，而一位忍术了得的日本忍者斯普林特也由于接触到这些物质而 变成了一只人形的老鼠。海龟们拜斯普林特为徒弟，学习忍术和功夫，并在电视台记者范宝儿和爱玛的协助下，与住在地层地下希图统治世界的克朗和他爪牙施莱德展开了一场又一场妥协。