第二季的故事将从上一季最后一集的情节拉开帷幕。警视厅搜索一科“特别立功对策室”自愿解散，室长大泽绘里子（天海佑希饰）引咎辞职，预备从成田机场动身回去美国，可是就在机场等候时她接到了野立信次郎（竹野内丰饰）的电话。警界高官黑原健蔵将成为反政府组织“黑月”的下一个狙击目的，而“黑月”重要成员高仓龙平在护送中逃脱。虽然绘里子和对策室各成员纷繁赶往现场，但黑原依然中弹，而犯人逃脱。身负重伤的黑原自愿辞职，为了承当责任，对策室再度解散，绘里子去了美国。两年后，当上参事官的野立以接手某个重要案件为契机，使得对策室再度复生。木元真实（户田惠梨香饰），片桐揣摩(玉山铁二饰)，花形一平(沟端淳平饰)，山村启辅(温水洋一饰)和岩井善治(小林友治饰)，这一班乌合之众能否还能再次聚首，为绘里子和对策室效能？而野立这一次能否依然可以压服绘里子担任室长一职？