故事发作在2029年，彼时，X战警早曾经解散，作为为数不多的仅存的变种人，金刚狼罗根（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）和卡利班（斯戴芬·莫昌特 Stephen Merchant 饰）照顾着年迈的X教授（帕特里克·斯图尔特 Patrick Stewart 饰），由于衰老，X教授曾经丧失了关于自己超才干的控制，假定不依赖药物，他的超才干就会失控，在全球范围内制造无法挽回的灾难。不只如此，金刚狼的自愈才干亦随着时间的流逝逐渐削弱，体能和力气都早曾经大不如从前。 某日，一位生疏女子找到了金刚狼，将一个名为劳拉（达芙妮·基恩 Dafne Keen 饰）的女孩拜托给他，吩咐他将劳拉送往位于加拿大边境的“伊甸园”。让罗根没有想到的是，劳拉居然是被植入了自己的基因此培育出的自然变种人，而在传说中的伊甸园里，有着一群和劳拉境遇相似的孩子。罪恶的唐纳德（波伊德·霍布鲁克 Boyd Holbrook 饰）紧紧的追踪着罗根一行人的踪迹，他的目的只需一个，就是将那群自然变种人彻底消灭。